47篇15分以上的文章,7月单细胞测序文

7月份

文献速递

大家好，每月的单细胞文献速递栏目又来啦，7月份单细胞领域又有哪些新的成果呢？

本期小编一共为大家统计了99篇7月份发表的9分以上单细胞测序相关文章，其中影响因子15.0以上的文章达到了47篇！

影响因子15.0以上的文章

小编对部分单细胞测序文章进行了导读，希望给大家带来单细胞研究的新思路。

1

标题：Cancercellsdeploylipocalin-2tocollectlimitingironinleptomeningealmetastasis

发表期刊：Science

影响因子：42

DOI：10./science.aaz

摘要：肿瘤微环境在肿瘤的发展过程，尤其在中枢神经系统的转移过程中起着重要的调节作用。充满脑脊液(CSF)的软脑膜中的癌细胞面临着包括炎症和稀少的微量营养素在内的巨大微环境挑战。为了研究脑膜转移瘤（LM）癌细胞克服微环境中的限制机制，文章对5名LM患者的脑脊液进行了单细胞RNA测序。结果发现，CSF中的癌细胞表达铁结合蛋白脂质蛋白2(LCN2)及其受体SCL22A17。巨噬细胞产生炎性细胞因子，诱导癌细胞表达LCN2，但自身不产生LCN2。在LM小鼠模型中，LCN2/SLC22A17系统支持癌细胞生长，铁螯合治疗可抑制癌细胞生长。可以推测，癌细胞通过LCN2与巨噬细胞争夺脑脊液中稀少的铁得以良好的生存。

2

标题：Single-cellsequencingofperipheralbloodmononuclearcellsrevealsdistinctimmuneresponselandscapesofCOVID-19andinfluenzapatients

发表期刊：Immunity

影响因子：23

DOI：10./j.immuni..07.

摘要：COVID-19是当前威胁全人类健康的一种严重的传染性疾病，然而与其他呼吸道传染病相比，人们对它的了解尚少。在该项工作中，研究人员利用单细胞测序技术，对纵向采集的COVID-19和甲型流感病毒(IAV)感染患者外周血单核细胞(PBMCs)进行了单细胞转录组分析。结果显示，COVID-19和IAV患者的浆细胞数目增加，COVID-19患者中XAF1、TNF和FAS诱导了T细胞的凋亡。进一步分析表明，COVID-19（STAT1和IRF3）与IAV（STAT3和NFκB）患者体内激活的信号通路不同，两者关键因子的表达存在实质性差异，COVID-19患者中IL6R和IL6ST的表达量相对增加，但IL-6的表达量升高程度与IAV患者相似，支持了临床上观察到的COVID-19患者促炎性细胞因子的增加的结论。该研究提供了COVID-19和IAV患者的PBMCs单细胞景观，并揭示了两者独特的免疫应答途径。

3

标题：ExcessivePolyamineGenerationinKeratinocytesPromotesSelf-RNASensingbyDendriticCellsinPsoriasis

发表期刊：Immunity

影响因子：23

DOI：10./j.immuni..06.

摘要：银屑病是一种多病因的慢性炎症性疾病，细胞代谢对银屑病的影响尚不清楚。研究人员报道了白介素-17(IL-17)下调了银屑病角化细胞中的蛋白磷酸酶6(PP6)，导致转录因子C/EBP-β的磷酸化并产生精氨酸酶-1。角化细胞中缺少pp6的小鼠易发生银屑病样皮肤炎症，pp6缺失的角化细胞中精氨酸酶-1的积累驱动尿素循环产生多胺。多胺可保护银屑病角化细胞释放的自身RNA免受降解，并促进髓样树突状细胞对自身RNA的内吞作用，从而促进依赖toll样受体7(TLR7)的RNA传感和IL-6的产生。此外，一种精氨酸酶抑制剂改善了银屑病小鼠和非人灵长类动物模型的皮肤炎症。该项研究结果表明，银屑病角化细胞中的尿素循环高反应性和生成过多的多胺促进了自身RNA传感，而角化细胞中的PP6缺失是放大银屑病炎症回路的关键事件。

4

标题：Single-celltranscriptomicsrevealsregulatorsunderlyingimmunecelldiversityandimmunesubtypesassociatedwithprognosisinnasopharyngealcarcinoma

发表期刊：CellResearch

影响因子：21

DOI：10./s---x

摘要：鼻咽癌是一种侵袭性的恶性肿瘤，且与种族和地理位置的分布极不平衡。越来越多的研究表明靶向肿瘤微环境(TME)是治疗鼻咽癌的一种很有前途的方法。为加深对复杂鼻咽癌TME的理解，研究人员对15个原发性鼻咽癌和1个正常样本中的个恶性细胞和个免疫细胞进行了单细胞转录组分析，揭示了捕获瘤内转录异质性和预测细胞侵袭性的恶性标记，并鉴定出多种免疫细胞亚型，包括新的细胞亚型如CLEC9A+树突细胞(DCs)。研究人员进一步揭示了免疫细胞多样性的转录调节机制，细胞互作分析突出了鼻咽癌潜在的免疫治疗靶点。此外，还建立了免疫细胞亚型特异性标记，并证明了巨噬细胞、浆性树突状细胞(pDCs)、CLEC9A+DC、自然杀伤细胞(NK)和浆细胞的特异性细胞标记与鼻咽癌的生存率显著相关。综上所述，该项研究为深入探讨鼻咽癌TME的细胞异质性提供了独特的资源，强调了抗癌治疗和风险分级的潜在生物标记，为鼻咽癌的精准治疗奠定了新的基础。

5

标题：SingleCellReconstructionofHumanBasalCellDiversityinNormalandIPFLung

发表期刊：AmericanJournalofRespiratoryandCriticalCareMedicine

影响因子：17

DOI：10./rccm.-OC

摘要：肺间质性疾病患者肺功能下降并伴有上皮重塑和气体交换区瘢痕化的增多。为更好地了解基底细胞增生和相关的粘液分泌功能障碍在特发性肺纤维化（IPF）病程中的作用，研究人员利用单细胞RNA测序技术绘制了正常对照和IPF患者的气道上皮细胞图谱，并用类器官和ALI培养来研究基底细胞亚型的功能特性。结果发现在成人肺组织对照组中，基底细胞包括多潜能和分泌启动亚群，分泌启动细胞亚群与IPF远端肺组织中的基底细胞具有一个相同的分子标记。研究人员证实了NOTCH2对基底细胞未分化状态的维持作用及其对基底细胞向纤毛细胞分化的限制作用，并证明NOTCH3具有抑制分泌细胞分化的功能。该项研究表明，基底细胞在疾病中受动态调节，在特发性肺纤维化中，基底细胞倾向于向分泌启动基底细胞亚群扩张，基底细胞可塑性的调节可能是治疗干预IPF的相关靶点。

6

标题：Single-cellRNAsequencingrevealsprofibroticrolesofdistinctepithelialandmesenchymallineagesinpulmonaryfibrosis

发表期刊：ScienceAdvances

影响因子：13

DOI：10./sciadv.aba

摘要：肺纤维化（PF）是一种慢性肺部疾病，其特征表现为病理性上皮重建和细胞外基质(ECM)的积累。为探究肺纤维化的细胞类型和驱动肺纤维化重构的机制，文章对10组非纤维化对照和20组肺纤维化的肺单细胞悬液进行了单细胞RNA测序。最终研究团队总共获得细胞的转录谱，并鉴定出31种不同的细胞亚群。此外，文章不仅报道了这些PF患者肺外周上皮细胞表型的显著变化，还确定了一些之前未被识别的上皮细胞表型，包括在PF患者肺中高度富集，具有KRT5/KRT17+病理性，能产生细胞外基质的上皮细胞群。作者还观察到多种成纤维细胞亚型以空间离散的方式促进ECM的扩张。总之，这些数据表明对上皮细胞和间充质细胞的多样性研究有助于挖掘病理性肺纤维化的机制。

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