系统性红斑狼疮是周身性疾病，在病情进展的过程中，很多脏器容易受到损害，所以脏器的损害程度是影响预后的一个十分重要的因素。为了评价SLE患者的器官损害程度和预后，系统性狼疮国际临床协作组和美国风湿病学学会（SLICC/ACR）提出了SLE的损伤指数(表)，所提到的临床表现一般应持续6个月以上，以排除急性活动期的表现。该指数采用积分方法对12个脏器的损伤程度进行评估，指数越高，提示预后越差。
为适应临床研究与实践的需要,系统性狼疮国际临床合作组与美国风湿病学会（SLICC/ACR）于年开始研制SLE损害指数。年，SLICC/ACR损害指数公开面世。年，SLICC/ACR对该损害指数又作了一些补充。SLICC/ACR损害指数包括12个脏器或系统的损害。
眼睛最大积分2分。其中包括任何原因(原发性或继发于激素治疗)的白内障1分;眼底镜检查证实的视网膜病变(可引起视野缺损)或视乳头萎缩症1分。
神经精神系统最大积分6分。其中识别力障碍(指记忆力缺损,计算困难,不能集中注意力,讲话或书写的表达困难,操作水平障碍)或明显的精神病1分；癫痫需要治疗≥6个月1分；脑血管意外1分,如果不止1次,并且先后间隔至少6个月,则记2分；颅神经或外周神经病变(除外视神经)1分；横贯性脊髓炎1分。
肾脏最大积分3分。估计的或测量的肾小球滤过率50%为1分；尿蛋白≥3.5g/24h为1分；或者,终末期肾病(透析或肾移植)则肾脏总的损害指数为3分。
肺脏最大积分5分。肺高压(右心室扩大或P2亢进)1分；肺纤维化(临床或X线诊断)1分；肺不张(X线诊断)1分；胸膜纤维化(X线诊断)1分；肺梗塞或非肿瘤所致的肺段切除手术1分。
心血管最大积分6分。心绞痛或冠状动脉供血不足1分；心肌梗死1分,如果不止1次，并且先后间隔至少6个月，则记1分；心肌病(心室功能不全)1分；心瓣膜病(舒张期杂音或收缩期杂音3/6)1分；心包炎持续6个月或接受心包切除术1分。
周围血管最大积分5分。跛行1分；小块组织丧失1分；明显的组织永久性丧失或切除（如指、趾或肢体丧失）1分，若超过1个部位记2分；伴有肿胀、溃疡形成的血管栓塞或血液淤积1分。
胃肠道最大积分6分。任何原因引起的十二指肠以下肠道、脾脏、肝脏、或胆囊的梗塞或切除1分，若超过1个部位记2分；肠系膜供血不足1分；慢性腹膜炎1分；狭窄或上消化道的外科手术1分；胰腺功能不全需要酶替代治疗或假性囊肿形成分。
肌肉骨骼最大积分7分。肌肉萎缩或无力1分；变形或侵蚀性关节炎（包括可复位的畸形，除外血管性坏死）1分；伴有骨折或脊椎压缩的骨质疏松（除外血管性坏死）1分；血管源性坏死1分，若超过1个部位记2分；骨髓炎1分；肌腱断裂1分。
皮肤最大积分3分。慢性疤痕性秃发1分；除外头皮和肉质部位的广泛性疤痕形成或脂质
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